Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PdgfaP20033 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PdgfaP20033 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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PdgfaP20033 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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