Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms