Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18532 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18532 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms