Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cd5P13379 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd5P13379 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms