Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms