Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms