Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms