Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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