Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
TtrP07309 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TtrP07309 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms