Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P04214 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04214 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04214 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04214 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04214 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04214 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04214 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04214 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms