Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P04212 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P04212 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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