Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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