Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lnx1O70263 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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