Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copb2O55029 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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