Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smarce1O54941 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarce1O54941 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms