Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh16O54909 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh16O54909 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rdh16O54909 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh16O54909 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh16O54909 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh16O54909 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh16O54909 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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