Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DffaO54786 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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