Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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