Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dgcr6O35347 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms