Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms