Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MsmbO08540 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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