Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms