Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm2035J3QP87 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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