Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms