Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Ccdc180J3QNE4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Ccdc180J3QNE4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc180J3QNE4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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