Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21244J3QK38 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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