Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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