Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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