Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sclt1G5E861 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms