Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms