Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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