Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Taf4E9QAP7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4E9QAP7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf4E9QAP7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf4E9QAP7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf4E9QAP7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf4E9QAP7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4E9QAP7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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