Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms