Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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