Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srp54bE9PXC0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms