Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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