Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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