Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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