Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp36B1AQJ2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp36B1AQJ2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp36B1AQJ2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp36B1AQJ2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp36B1AQJ2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp36B1AQJ2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp36B1AQJ2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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