Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms