Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms