Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms