Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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