Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csmd2V9GX34 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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