Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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