Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms