Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek4Q9Z1J2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek4Q9Z1J2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms