Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psma1Q9R1P4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms