Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms