Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Kcnip3Q9QXT8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Kcnip3Q9QXT8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Kcnip3Q9QXT8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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